MOQA : Méta-données et Ontologies pour la Qualité des Annotations

Présentations

Les supports des présentations orales sont disponibles à partir du répertoire MOQA JOBIM 2010

6 Septembre 2010 de 9h30 à 18h
Hébergé sur le même site que la conférence JOBIM

Il est temps de proposer un résumé pour ceux et celles qui aimeraient s'exprimer (présentation flash) autour des thèmes de MOQA le 6 Septembre. Ces présentations courtes viendront compléter des présentations plus longues dont l'énumération sera publiée très prochainement.

Ces résumés sont à envoyer avant le 10 Juillet, une réponse sera donnée autour du 20 Juillet.

La journée satellite MOQA se veut un lieu d'échange propice à des discussions scientifiques fructueuses autour des modèles de données et de connaissances dans les sciences du vivant. L'accent est, plus volontiers, mis sur la génomique fonctionnelle, et notamment sur l'interprétation des séquences biologiques, cependant tout autre champ d'investigation du vivant reste le bienvenu.

La journée MOQA est un prolongement, en terme d'activité d'animation, des journées satellites Jobim nommées OGSB'05 et OGSB'06 et des actions concertées incitatives (ACI IMPBio) OntoBio et IsiBio.

La journée reprendra les thèmes introduits lors de la journée MOQA du GDR BIM. La journée sera organisée de manière concertée avec la journée Annotation des génomes (le vendredi 10 septembre).

Nous compterons, Ulf Leser, de l'Université de Berlin comme orateur invité.

Les thèmes définis au sein de MOQA, portent en particulier, mais non exclusivement, sur :

  • 10:00 Accueil Inscription (cafétéria)
  • 10:15 Introduction Journée Salle 104
  • 10:20 Anne Tireau (INRA Montpellier) Using ontologies for R function management
  • 11:00 Pause Cafétéria
  • 11:35 Véronique Giudicelli (IGH Montpellier) Ce qu'apporte OWL à la formalisation d'IMGT-Ontology
  • 12:15 Julien Wollbrett (CIRAD Montpellier) Intégration sémantique automatisée de données pour l'analyse de la diversité génétique des plantes
  • 12:55 Isabelle Mougenot (Lirmm Montpellier) normes de qualité empruntées à la géographie pour l'annotation en biologie
  • 13:30 Repas Cafétéria
  • 14:50 Pierre Tuffery (Univ. Diderot Paris) Semantic Map for Structural Bioinformatics: enhanced service discovery based on high level concept ontology
  • 15:20 Daniel Jacob (CBIB Bordeaux) Une plate-forme d'intégration de données sémantiques pour le domaine métabolomique
  • 16:00 Pause Cafétéria
  • 16:35 Discussion clôturant la journée

Programme de la journée:

Inscription (gratuite mais obligatoire):

Isabelle Mougenot (isabelle.mougenot \at\ lirmm.fr).

Comité d'organisation :

Sarah Cohen-Boulakia (LRI), Julie Chabalier (Natural Solutions), Emmanuel Cornillot (Univ. Montpellier I), Marie-Dominique Devignes (LORIA), Christine Froidevaux (LRI), Zoe Lacroix (TGen, Arizona State University), Pierre Larmande (CIRAD), Marie-Paule Lefranc (IMGT), Valentin Loux (INRA) , Karyn Megy (EBI), Isabelle Mougenot (Univ. Montpellier II), Fleur Mougin (Univ. Bordeaux II), Fouzia Moussouni (Univ. Rennes I), Guy Perriere (Univ. Lyon I), Manuel Ruiz (CIRAD),  Stéphanie Sidibe-Bocs (CIRAD), Malika Smail (LORIA)